The number of international benchmarking competitions is steadily increasing in various fields of machine learning (ML) research and practice. So far, however, little is known about the common practice as well as bottlenecks faced by the community in tackling the research questions posed. To shed light on the status quo of algorithm development in the specific field of biomedical imaging analysis, we designed an international survey that was issued to all participants of challenges conducted in conjunction with the IEEE ISBI 2021 and MICCAI 2021 conferences (80 competitions in total). The survey covered participants' expertise and working environments, their chosen strategies, as well as algorithm characteristics. A median of 72% challenge participants took part in the survey. According to our results, knowledge exchange was the primary incentive (70%) for participation, while the reception of prize money played only a minor role (16%). While a median of 80 working hours was spent on method development, a large portion of participants stated that they did not have enough time for method development (32%). 25% perceived the infrastructure to be a bottleneck. Overall, 94% of all solutions were deep learning-based. Of these, 84% were based on standard architectures. 43% of the respondents reported that the data samples (e.g., images) were too large to be processed at once. This was most commonly addressed by patch-based training (69%), downsampling (37%), and solving 3D analysis tasks as a series of 2D tasks. K-fold cross-validation on the training set was performed by only 37% of the participants and only 50% of the participants performed ensembling based on multiple identical models (61%) or heterogeneous models (39%). 48% of the respondents applied postprocessing steps.
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深度学习(DL)模型为各种医学成像基准挑战提供了最先进的性能,包括脑肿瘤细分(BRATS)挑战。然而,局灶性病理多隔室分割(例如,肿瘤和病变子区)的任务特别具有挑战性,并且潜在的错误阻碍DL模型转化为临床工作流程。量化不确定形式的DL模型预测的可靠性,可以实现最不确定的地区的临床审查,从而建立信任并铺平临床翻译。最近,已经引入了许多不确定性估计方法,用于DL医学图像分割任务。开发指标评估和比较不确定性措施的表现将有助于最终用户制定更明智的决策。在本研究中,我们探索并评估在Brats 2019-2020任务期间开发的公制,以对不确定量化量化(Qu-Brats),并旨在评估和排列脑肿瘤多隔室分割的不确定性估计。该公制(1)奖励不确定性估计,对正确断言产生高置信度,以及在不正确的断言处分配低置信水平的估计数,(2)惩罚导致更高百分比的无关正确断言百分比的不确定性措施。我们进一步基准测试由14个独立参与的Qu-Brats 2020的分割不确定性,所有这些都参与了主要的Brats细分任务。总体而言,我们的研究结果证实了不确定性估计提供了分割算法的重要性和互补价值,因此突出了医学图像分析中不确定性量化的需求。我们的评估代码在HTTPS://github.com/ragmeh11/qu-brats公开提供。
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多发性硬化症(MS)是中枢神经系统的慢性炎症和退行性疾病,其特征在于,白色和灰质的外观与个体患者的神经症状和标志进行地平整相关。磁共振成像(MRI)提供了详细的体内结构信息,允许定量和分类MS病变,其批判性地通知疾病管理。传统上,MS病变在2D MRI切片上手动注释,一个流程效率低,易于观察室内误差。最近,已经提出了自动统计成像分析技术以基于MRI体素强度检测和分段段病变。然而,它们的有效性受到MRI数据采集技术的异质性和MS病变的外观的限制。通过直接从图像学习复杂的病变表现,深度学习技术已经在MS病变分割任务中取得了显着的突破。在这里,我们提供了全面审查最先进的自动统计和深度学习MS分段方法,并讨论当前和未来的临床应用。此外,我们审查了域适应等技术策略,以增强现实世界临床环境中的MS病变分段。
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Language-conditioned policies allow robots to interpret and execute human instructions. Learning such policies requires a substantial investment with regards to time and compute resources. Still, the resulting controllers are highly device-specific and cannot easily be transferred to a robot with different morphology, capability, appearance or dynamics. In this paper, we propose a sample-efficient approach for training language-conditioned manipulation policies that allows for rapid transfer across different types of robots. By introducing a novel method, namely Hierarchical Modularity, and adopting supervised attention across multiple sub-modules, we bridge the divide between modular and end-to-end learning and enable the reuse of functional building blocks. In both simulated and real world robot manipulation experiments, we demonstrate that our method outperforms the current state-of-the-art methods and can transfer policies across 4 different robots in a sample-efficient manner. Finally, we show that the functionality of learned sub-modules is maintained beyond the training process and can be used to introspect the robot decision-making process. Code is available at https://github.com/ir-lab/ModAttn.
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人类仍在执行许多高精度(DIS)任务,而这是自动化的理想机会。本文提供了一个框架,该框架使非专家的人类操作员能够教机器人手臂执行复杂的精确任务。该框架使用可变的笛卡尔阻抗控制器来执行从动力学人类示范中学到的轨迹。可以给出反馈以进行交互重塑或加快原始演示。董事会本地化是通过对任务委员会位置的视觉估算来完成的,并通过触觉反馈进行了完善。我们的框架在机器人基准拆卸挑战上进行了测试,该机器人必须执行复杂的精确任务,例如关键插入。结果显示每个操纵子任务的成功率很高,包括盒子中新型姿势的情况。还进行了消融研究以评估框架的组成部分。
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机器学习(ML)为生物处理工程的发展做出了重大贡献,但其应用仍然有限,阻碍了生物过程自动化的巨大潜力。用于模型构建自动化的ML可以看作是引入另一种抽象水平的一种方式,将专家的人类集中在生物过程开发的最认知任务中。首先,概率编程用于预测模型的自动构建。其次,机器学习会通过计划实验来测试假设并进行调查以收集信息性数据来自动评估替代决策,以收集基于模型预测不确定性的模型选择的信息数据。这篇评论提供了有关生物处理开发中基于ML的自动化的全面概述。一方面,生物技术和生物工程社区应意识到现有ML解决方案在生物技术和生物制药中的应用的限制。另一方面,必须确定缺失的链接,以使ML和人工智能(AI)解决方案轻松实施在有价值的生物社区解决方案中。我们总结了几个重要的生物处理系统的ML实施,并提出了两个至关重要的挑战,这些挑战仍然是生物技术自动化的瓶颈,并减少了生物技术开发的不确定性。没有一个合适的程序;但是,这项综述应有助于确定结合生物技术和ML领域的潜在自动化。
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国际危机如何展开?我们将国际关系概念化为对手之间的战略国际象棋游戏,并开发了一种系统的方法,以准确且一致的历史准确,一致地测量碎片,移动和gam。我们基于国际危机行为(ICB)项目的非常高质量的叙事语料库,介绍了一个名为ICBE的国际事件的新本体和数据集。我们证明,ICBE的覆盖范围,召回和精度比现有数据集的现有状态更高,并进行了两项关于古巴导弹危机(1962)和Crimea-Donbas危机(2014)的详细案例研究。我们进一步介绍了两个新的事件可视化(事件Icongraphy和危机地图),这是一种使用自然语言处理(Sythnetic叙述)测量事件召回的自动基准,以及用于客观测量事件精确度的本体论重建任务。我们在伴侣网站www.crisisevents.org和github存储库中提供数据,在线附录,复制材料以及可视化的可视化材料和可视化。
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预测Twitter等社交媒体用户的地理位置已经发现了几种在健康监测,紧急监测,内容个性化和社会研究中的应用。在这项工作中,我们通过设计和评估基于加权多层的文献的新方法对该领域的研究有助于与最先进的深度学习技术相结合。探索的方法从类似的底层结构(扩展提及和/或跟随网络)出发,而是使用不同的信息处理策略,例如,通过转换和归纳算法 - RGCNS和GraphSage的信息扩散,以及节点嵌入node2vec +。然后,这些图形与注意机制结合到将用户的文本视图结合到模型中。我们评估每个方法的性能,并将它们与基线模型进行比较,在公开的推特 - 美国数据集中;我们还根据拉丁美洲的大型Twitter捕获,提供新的数据集。最后,我们的工作讨论了在不同标签定义和指标的背景下的方法中的比较的局限性和有效性。
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我们提出了分析分层聚类的方法,这些聚类完全使用了树木图提供的多分辨率结构。具体地,我们提出了在聚类方法之间选择的损失,特征重要性分数和用于可视化树木图中的特征分割的图形工具。这些任务的当前方法导致信息丢失,因为它们要求用户通过在指定级别切割树木图来生成本实例的单个分区。我们提出的方法使用了树木图的全结构。所提出的方法背后的关键洞察是将树形图视为系统发育。该类比允许通过祖先状态重建向树的每个内部节点分配特征值。真实和模拟数据集提供了证据表明我们所提出的框架具有理想的结果。我们提供了实现我们方法的R包。
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我们考虑随着延迟梯度的随机优化,在每次步骤$ $,该算法使用步骤$ t-d_t $的陈旧随机梯度进行更新,从而为某些任意延迟$ d_t $。此设置摘要异步分布式优化,其中中央服务器接收由工作人员计算的渐变更新。这些机器可以体验可能随时间变化而变化的计算和通信负载。在一般的非凸平滑优化设置中,我们提供了一种简单且高效的算法,需要$ o(\ sigma ^ 2 / \ epsilon ^ 4 + \ tau / epsilon ^ 2)$步骤查找$ \ epsilon $ - 静止点$ x $,其中$ \ tau $是\ emph {平均}延迟$ \ smash {\ frac {1} {t} \ sum_ {t = 1} ^ t d_t} $和$ \ sigma ^ 2 $是随机梯度的方差。这改善了以前的工作,这表明随机梯度体面可以实现相同的速率,而是相对于\ emph {maximal}延迟$ \ max_ {t} d_t $,这可以显着大于平均延迟,特别是在异构分布式系统中。我们的实验证明了我们算法在延迟分布歪斜或重尾的情况下的效力和稳健性。
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